宅基地合作建房协议无效，因违反法律规定。依据《土地管理法》等，农村集体土地不得非法转让，合作建房实为非法转让宅基地，法院不予支持，可能导致损失无法追回。
✫✫✫✫✫有法律问题，请打电话15555555523（123中间8个5），微信同号，免费咨询✫✫✫✫✫
协议无效。处理操作：1. 与对方协商，明确协议无效及损失分担；2. 收集证据，包括协议、支付凭证等；3. 若协商无果，向法院起诉，请求确认协议无效，并主张损失赔偿。
✫✫✫✫✫有法律问题，请打电话15555555523（123中间8个5），微信同号，免费咨询✫✫✫✫✫
处理宅基地合作建房协议无效问题，常见方式为协商、诉讼。双方可先尝试协商解决损失分担；协商不成时，可向法院提起诉讼，请求确认协议无效并处理后续事宜。